2006: Universidade nota máxima.

No mesmo ano, a Unisc inaugura seu Curso de Medicina e obtém nota máxima na avaliação do INEP, que analisa universidade de todo o Brasil. Poucas instituições gaúchas haviam conseguido marca tão importante, reconhecimento de muito trabalho desde os tempos de FISC. No Campus-Sede da Unisc é inaugurado o bloco 54, que abriga os cursos de engenharia, e no Hospital Santa Cruz é criado o Centro de Diagnósticos e Intervenção por Imagem (CDII).